Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc1Q5NCF2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc1Q5NCF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc1Q5NCF2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc1Q5NCF2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc1Q5NCF2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms