Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
L1td1Q587J6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1td1Q587J6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
L1td1Q587J6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1td1Q587J6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
L1td1Q587J6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1td1Q587J6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1td1Q587J6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1td1Q587J6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1td1Q587J6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1td1Q587J6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1td1Q587J6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
L1td1Q587J6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1td1Q587J6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1td1Q587J6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
L1td1Q587J6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms