Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAB4

Cnpy1, Protein canopy homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy1Q4VAB4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnpy1Q4VAB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnpy1Q4VAB4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnpy1Q4VAB4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy1Q4VAB4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnpy1Q4VAB4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnpy1Q4VAB4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnpy1Q4VAB4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnpy1Q4VAB4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnpy1Q4VAB4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnpy1Q4VAB4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnpy1Q4VAB4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnpy1Q4VAB4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms