Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pacs2Q3V3Q7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacs2Q3V3Q7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pacs2Q3V3Q7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pacs2Q3V3Q7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pacs2Q3V3Q7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms