Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm906Q3V0M1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm906Q3V0M1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm906Q3V0M1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm906Q3V0M1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm906Q3V0M1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm906Q3V0M1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm906Q3V0M1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm906Q3V0M1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm906Q3V0M1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm906Q3V0M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm906Q3V0M1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm906Q3V0M1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm906Q3V0M1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm906Q3V0M1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms