Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SvipQ3UZP4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SvipQ3UZP4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SvipQ3UZP4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SvipQ3UZP4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvipQ3UZP4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SvipQ3UZP4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms