Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc160Q3UYG1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc160Q3UYG1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc160Q3UYG1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc160Q3UYG1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc160Q3UYG1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc160Q3UYG1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc160Q3UYG1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms