Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrc1Q3UPH1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc1Q3UPH1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrc1Q3UPH1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrc1Q3UPH1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrc1Q3UPH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrc1Q3UPH1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms