Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPF5

Zc3hav1, Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3hav1Q3UPF5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3hav1Q3UPF5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3hav1Q3UPF5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3hav1Q3UPF5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zc3hav1Q3UPF5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3hav1Q3UPF5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3hav1Q3UPF5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3hav1Q3UPF5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3hav1Q3UPF5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms