Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pin1rt1Q3ULQ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pin1rt1Q3ULQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pin1rt1Q3ULQ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin1rt1Q3ULQ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pin1rt1Q3ULQ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms