Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5113Q3UGK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5113Q3UGK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5113Q3UGK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5113Q3UGK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5113Q3UGK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5113Q3UGK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5113Q3UGK8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5113Q3UGK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5113Q3UGK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms