Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcaf17Q3TUL7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcaf17Q3TUL7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcaf17Q3TUL7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dcaf17Q3TUL7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcaf17Q3TUL7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Dcaf17Q3TUL7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dcaf17Q3TUL7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dcaf17Q3TUL7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dcaf17Q3TUL7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dcaf17Q3TUL7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcaf17Q3TUL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms