Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tamm41Q3TUH1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tamm41Q3TUH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tamm41Q3TUH1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tamm41Q3TUH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tamm41Q3TUH1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tamm41Q3TUH1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tamm41Q3TUH1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tamm41Q3TUH1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tamm41Q3TUH1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tamm41Q3TUH1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tamm41Q3TUH1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tamm41Q3TUH1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms