Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRJ4

Krt26, Keratin, type I cytoskeletal 26, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt26Q3TRJ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt26Q3TRJ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt26Q3TRJ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt26Q3TRJ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt26Q3TRJ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt26Q3TRJ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt26Q3TRJ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt26Q3TRJ4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt26Q3TRJ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt26Q3TRJ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms