Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp39Q3TIX9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp39Q3TIX9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp39Q3TIX9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp39Q3TIX9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp39Q3TIX9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp39Q3TIX9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp39Q3TIX9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp39Q3TIX9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms