Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2f1Q3THK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf2f1Q3THK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf2f1Q3THK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2f1Q3THK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2f1Q3THK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2f1Q3THK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2f1Q3THK3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf2f1Q3THK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gtf2f1Q3THK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf2f1Q3THK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf2f1Q3THK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms