Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem104Q3TB48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem104Q3TB48 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem104Q3TB48 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem104Q3TB48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem104Q3TB48 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem104Q3TB48 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem104Q3TB48 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms