Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr27Q3SYJ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr27Q3SYJ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prr27Q3SYJ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr27Q3SYJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr27Q3SYJ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr27Q3SYJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms