Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hddc2Q3SXD3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hddc2Q3SXD3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hddc2Q3SXD3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hddc2Q3SXD3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hddc2Q3SXD3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hddc2Q3SXD3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hddc2Q3SXD3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms