Protein–RNA interactions for Protein: Q3LS21

Kcnk9, Potassium channel subfamily K member 9, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk9Q3LS21 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnk9Q3LS21 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnk9Q3LS21 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk9Q3LS21 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk9Q3LS21 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnk9Q3LS21 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk9Q3LS21 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnk9Q3LS21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms