Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxi2Q3I5G5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxi2Q3I5G5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxi2Q3I5G5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxi2Q3I5G5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxi2Q3I5G5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxi2Q3I5G5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms