Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ssrp1Q08943 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssrp1Q08943 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ssrp1Q08943 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssrp1Q08943 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssrp1Q08943 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssrp1Q08943 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ssrp1Q08943 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssrp1Q08943 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms