Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrstQ06666 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrstQ06666 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SrstQ06666 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrstQ06666 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrstQ06666 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrstQ06666 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrstQ06666 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrstQ06666 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrstQ06666 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrstQ06666 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrstQ06666 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrstQ06666 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrstQ06666 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrstQ06666 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms