Protein–RNA interactions for Protein: Q05AC5

4930430A15Rik, RIKEN cDNA 4930430A15, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930430A15RikQ05AC5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930430A15RikQ05AC5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930430A15RikQ05AC5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4930430A15RikQ05AC5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930430A15RikQ05AC5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930430A15RikQ05AC5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4930430A15RikQ05AC5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930430A15RikQ05AC5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930430A15RikQ05AC5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms