Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r236Q05A06 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r236Q05A06 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r236Q05A06 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r236Q05A06 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Vmn1r236Q05A06 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r236Q05A06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms