Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rcn1Q05186 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rcn1Q05186 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rcn1Q05186 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rcn1Q05186 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rcn1Q05186 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rcn1Q05186 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rcn1Q05186 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rcn1Q05186 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rcn1Q05186 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rcn1Q05186 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rcn1Q05186 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rcn1Q05186 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rcn1Q05186 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rcn1Q05186 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rcn1Q05186 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rcn1Q05186 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rcn1Q05186 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rcn1Q05186 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rcn1Q05186 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rcn1Q05186 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms