Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcqQ02111 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkcqQ02111 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcqQ02111 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrkcqQ02111 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcqQ02111 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcqQ02111 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcqQ02111 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms