Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx2Q00262 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx2Q00262 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx2Q00262 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx2Q00262 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx2Q00262 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx2Q00262 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms