Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn1bP97952 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1bP97952 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn1bP97952 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn1bP97952 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1bP97952 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1bP97952 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1bP97952 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms