Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bop1P97452 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bop1P97452 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bop1P97452 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bop1P97452 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bop1P97452 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bop1P97452 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bop1P97452 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bop1P97452 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bop1P97452 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bop1P97452 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bop1P97452 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bop1P97452 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bop1P97452 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Bop1P97452 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bop1P97452 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bop1P97452 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bop1P97452 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms