Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sfrp2P97299 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfrp2P97299 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfrp2P97299 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfrp2P97299 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sfrp2P97299 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sfrp2P97299 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sfrp2P97299 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfrp2P97299 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfrp2P97299 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sfrp2P97299 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms