Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp8a1P70704 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp8a1P70704 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp8a1P70704 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp8a1P70704 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp8a1P70704 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp8a1P70704 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp8a1P70704 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp8a1P70704 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp8a1P70704 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp8a1P70704 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp8a1P70704 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp8a1P70704 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp8a1P70704 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms