Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ErfP70459 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ErfP70459 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ErfP70459 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ErfP70459 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ErfP70459 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ErfP70459 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ErfP70459 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ErfP70459 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ErfP70459 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ErfP70459 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ErfP70459 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ErfP70459 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ErfP70459 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ErfP70459 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ErfP70459 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ErfP70459 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ErfP70459 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ErfP70459 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ErfP70459 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ErfP70459 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ErfP70459 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ErfP70459 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ErfP70459 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ErfP70459 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ErfP70459 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ErfP70459 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ErfP70459 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ErfP70459 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ErfP70459 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ErfP70459 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ErfP70459 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ErfP70459 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErfP70459 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ErfP70459 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ErfP70459 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErfP70459 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ErfP70459 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErfP70459 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErfP70459 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErfP70459 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErfP70459 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ErfP70459 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErfP70459 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErfP70459 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErfP70459 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErfP70459 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ErfP70459 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ErfP70459 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ErfP70459 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ErfP70459 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ErfP70459 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErfP70459 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ErfP70459 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ErfP70459 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErfP70459 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ErfP70459 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErfP70459 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErfP70459 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErfP70459 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErfP70459 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErfP70459 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErfP70459 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErfP70459 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErfP70459 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ErfP70459 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ErfP70459 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErfP70459 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErfP70459 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErfP70459 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErfP70459 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErfP70459 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ErfP70459 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ErfP70459 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ErfP70459 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ErfP70459 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ErfP70459 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErfP70459 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErfP70459 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErfP70459 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErfP70459 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErfP70459 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErfP70459 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErfP70459 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErfP70459 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErfP70459 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErfP70459 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErfP70459 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErfP70459 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErfP70459 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErfP70459 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErfP70459 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErfP70459 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ErfP70459 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ErfP70459 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ErfP70459 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErfP70459 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErfP70459 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErfP70459 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErfP70459 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms