Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sumo1P63166 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sumo1P63166 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sumo1P63166 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sumo1P63166 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sumo1P63166 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sumo1P63166 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo1P63166 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sumo1P63166 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sumo1P63166 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sumo1P63166 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sumo1P63166 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sumo1P63166 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms