Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Barhl1P63157 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Barhl1P63157 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barhl1P63157 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barhl1P63157 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barhl1P63157 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Barhl1P63157 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barhl1P63157 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms