Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lsm5P62322 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm5P62322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm5P62322 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm5P62322 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm5P62322 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm5P62322 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms