Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrn4P59383 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrn4P59383 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrn4P59383 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrn4P59383 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrn4P59383 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrn4P59383 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrn4P59383 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
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