Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NcstnP57716 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcstnP57716 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcstnP57716 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcstnP57716 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NcstnP57716 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcstnP57716 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NcstnP57716 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NcstnP57716 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NcstnP57716 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NcstnP57716 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NcstnP57716 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NcstnP57716 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NcstnP57716 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NcstnP57716 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcstnP57716 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NcstnP57716 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NcstnP57716 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.6 ms