Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp1P56183 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp1P56183 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp1P56183 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp1P56183 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp1P56183 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp1P56183 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp1P56183 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrp1P56183 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrp1P56183 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp1P56183 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rrp1P56183 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rrp1P56183 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rrp1P56183 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrp1P56183 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp1P56183 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rrp1P56183 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp1P56183 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp1P56183 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp1P56183 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp1P56183 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp1P56183 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp1P56183 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp1P56183 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp1P56183 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp1P56183 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp1P56183 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp1P56183 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rrp1P56183 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Rrp1P56183 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp1P56183 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp1P56183 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp1P56183 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp1P56183 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp1P56183 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp1P56183 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms