Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FmodP50608 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FmodP50608 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FmodP50608 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FmodP50608 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FmodP50608 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FmodP50608 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FmodP50608 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FmodP50608 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FmodP50608 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FmodP50608 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FmodP50608 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FmodP50608 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FmodP50608 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FmodP50608 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FmodP50608 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FmodP50608 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FmodP50608 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FmodP50608 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FmodP50608 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FmodP50608 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FmodP50608 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FmodP50608 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FmodP50608 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FmodP50608 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FmodP50608 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FmodP50608 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FmodP50608 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FmodP50608 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FmodP50608 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FmodP50608 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FmodP50608 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FmodP50608 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FmodP50608 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FmodP50608 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FmodP50608 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FmodP50608 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FmodP50608 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FmodP50608 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FmodP50608 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FmodP50608 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FmodP50608 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FmodP50608 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FmodP50608 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FmodP50608 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FmodP50608 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FmodP50608 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FmodP50608 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FmodP50608 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FmodP50608 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FmodP50608 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FmodP50608 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FmodP50608 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FmodP50608 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FmodP50608 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FmodP50608 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FmodP50608 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FmodP50608 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FmodP50608 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FmodP50608 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FmodP50608 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FmodP50608 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FmodP50608 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FmodP50608 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms