Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrb1P50571 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabrb1P50571 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabrb1P50571 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabrb1P50571 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabrb1P50571 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabrb1P50571 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb1P50571 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms