Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdkn1cP49919 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdkn1cP49919 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdkn1cP49919 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdkn1cP49919 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdkn1cP49919 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdkn1cP49919 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdkn1cP49919 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdkn1cP49919 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdkn1cP49919 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdkn1cP49919 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdkn1cP49919 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms