Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hcls1P49710 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hcls1P49710 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hcls1P49710 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hcls1P49710 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hcls1P49710 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hcls1P49710 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms