Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox2P48432 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox2P48432 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox2P48432 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox2P48432 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox2P48432 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox2P48432 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox2P48432 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox2P48432 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox2P48432 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sox2P48432 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox2P48432 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox2P48432 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox2P48432 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox2P48432 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox2P48432 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox2P48432 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox2P48432 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox2P48432 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox2P48432 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms