Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb41P48193 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb41P48193 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb41P48193 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epb41P48193 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Epb41P48193 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epb41P48193 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Epb41P48193 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Epb41P48193 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Epb41P48193 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Epb41P48193 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epb41P48193 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epb41P48193 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41P48193 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41P48193 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41P48193 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Epb41P48193 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41P48193 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms