Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl6P47911 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl6P47911 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl6P47911 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl6P47911 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl6P47911 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rpl6P47911 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl6P47911 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl6P47911 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms