Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nkx2-5P42582 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx2-5P42582 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx2-5P42582 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-5P42582 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-5P42582 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-5P42582 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-5P42582 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-5P42582 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-5P42582 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms