Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ThpoP40226 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ThpoP40226 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ThpoP40226 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ThpoP40226 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ThpoP40226 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ThpoP40226 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ThpoP40226 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ThpoP40226 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThpoP40226 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ThpoP40226 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThpoP40226 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThpoP40226 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ThpoP40226 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ThpoP40226 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ThpoP40226 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ThpoP40226 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThpoP40226 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThpoP40226 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ThpoP40226 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ThpoP40226 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ThpoP40226 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms