Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cd22P35329 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cd22P35329 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cd22P35329 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cd22P35329 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cd22P35329 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd22P35329 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cd22P35329 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cd22P35329 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cd22P35329 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cd22P35329 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cd22P35329 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cd22P35329 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cd22P35329 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd22P35329 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd22P35329 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd22P35329 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd22P35329 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cd22P35329 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd22P35329 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd22P35329 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd22P35329 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd22P35329 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cd22P35329 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd22P35329 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd22P35329 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd22P35329 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cd22P35329 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd22P35329 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd22P35329 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd22P35329 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd22P35329 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd22P35329 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd22P35329 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd22P35329 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd22P35329 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd22P35329 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cd22P35329 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cd22P35329 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cd22P35329 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cd22P35329 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cd22P35329 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cd22P35329 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd22P35329 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd22P35329 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd22P35329 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd22P35329 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms