Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stfa3P35173 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stfa3P35173 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Stfa3P35173 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stfa3P35173 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stfa3P35173 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stfa3P35173 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165 ms